中心共有各类数字文献7万余种。主要有:近代报刊系列、《北京大学图书馆藏稿本丛书》、《北京图书馆古籍珍本丛刊》、《卜筮全书》、《二十四史订补》、《二十四史三编》、《古逸丛书》、《永乐北藏》、《康熙朝汉文朱批奏折》、《雍正朝汉文朱批奏摺汇编》、《乾隆朝上谕档》、《咸丰同治两朝上谕档》、《光绪朝上谕档》、《海山仙馆丛书》、《海王邨古籍丛刊》、《嘉靖中福建刊本》、《奎章阁汉文文献》、《清代稿本百种汇刊》、《天一阁藏明代方志丛刊》、《乾隆大藏经》、《续修四库全书》、《四库全书存目丛书》、《四库禁毁书丛刊》、《四库未收书丛刊》、《先秦--清末中国野史集成》、《中国方志丛书》、《近代中国史料丛刊》、《近代中国史料丛刊续编》、《民国丛书》、《台湾文献丛刊》、《中华民国史史料长编》、《汪伪政府行政院会议录》等。